SEASON 3 EPISODE 1. 사라진 소년
보트가 다리에 충돌하여 다리의 일부분이 붕괴하는 사건이 일어나고 보트에서 한 남자의 시신이 발견된다. 죽은 남자의 집을 찾아간 호라시오는 그의 아내로부터 어린 아들이 유괴됐으며 남편이 유괴범들에게 몸값을 주러 나갔다는 말을 듣게 된다. 그러나 몸값으로 주었던 보석이 가짜였으며 이로 인해 남편이 유괴범들에게 살해된 것으로 드러나고 아이의 엄마가 새엄마임이 밝혀지자 새엄마가 공범으로 몰리게 된다. 한편, 평소 보석 세척을 맡기던 보석상을 찾아간 호라시오와 스피들은 뜻밖의 총격전에 휘말리고 스피들이 총에 맞아 사망하는데....
EPISODE 2. 위험한 피고인
지나가던 보트에서 난사된 총에 파티에 참석한 한 여자가 피살되고 파티의 주최자인 데니스는 옛 동료였던 바이런을 범인으로 지목한다. 바이런은 증거 인멸을 위해 자기 자신의 변호인으로 나서고, 증인으로 나선 데니스는 오히려 법정 모독죄로 수감된 뒤 감방에서 바이런의 수하에 의해 살해된다. 피살된 여자의 어린 아들 스티비 역시 바이런을 범인으로 지목하지만 호라시오는 스티브를 보호하기 위해 아이를 증인 명단에서 제외한다. 그러나 스티비 역시 바이런에 의해 생명의 위협을 받게 되고 범행에 사용된 바이런의 보트에서 또 다른 시신이 발견되는데...
EPISODE 3. 가려진 진범
거리에서 카트리나라는 여자가 버스에 치이고 누군가 뒤에서 떠민 것으로 밝혀진다. 그녀가 죽기 전 그녀의 지갑을 턴 남자가 체포되지만, 카트리나의 남자친구인 제이의 직장에서 또 다른 남자의 시신이 발견되고 제이는 클라우디아라는 예전 여자친구가 자신을 스토킹 해 왔다고 고백한다. 범인은 클라우디아로 밝혀지지만 제이를 의심한 호라시오는 제이와 연관된 또 다른 미해결 살인 사건을 찾아내는데... 한편, 칼리의 아버지가 음주 운전으로 사람을 친 것 같다며 칼리를 찾아오고, 칼리는 사건을 맡고 싶어 하지만 호라시오는 사건을 신참인 라이언에게 맡긴다.
EPISODE 4. 군중 속의 살인
일단의 학생들이 골프장에서 '플래시몹'을 벌인 후, 한 사립 고교 남학생인 대니의 시체가 발견된다. 대니는 화학 교사로부터 시험지를 훔쳐 돈을 받고 다른 학생들에게 팔아 왔는데, 이에 불만을 품은 교장의 딸 스테파니가 대니를 술에 취하게 한 뒤 시험지를 못 팔게 하려다가 그만 죽이고 만 것.
EPISODE 5. 잠복근무
알코올 단속반의 수사 도우미로 나이트클럽에서 미성년자 알코올 판매 관련 잠복근무를 하던 18세 소녀, 제니가 살해된다. 범인은 제니와 마지막으로 키스한 케빈으로 밝혀진다.
한편, 마사지 살롱에서도 한 남자가 살해되고, 마사지 살롱의 주인과 나이트클럽 주인은 헝가리 여자들을 미국에 데려와 노예처럼 파는 인신매매단의 일부임이 드러나는데...
EPISODE 6. 할로윈의 밤
아내를 살해한 죄로 기소된 '도니 로페즈' 사건의 배심원단은 살인현장을 둘러보기 위해 도니의 집을 방문한다. 그 때 한 여성이 갑자기 발작을 일으키고, 이 어수선한 틈을 타 도니가 살해당하는 사건이 발생한다.
사건 현장을 둘러보던 호라시오는 레이가 집에 돌아오지 않았다는 옐리나의 전화를 받고, 거리에서 친구들과 놀던 레이를 찾아 집으로 돌려보낸다.
과학수사대는 범인이 남긴 '유죄'라는 메모를 단서로 해서 배심원이 범인임을 알아내고, 그 날 밤 치어리더가 도니의 애인이었던 켈리의 부탁으로 고의로 발작을 일으켰음을 알게 된다. 그러나 필적 감정 결과 켈리는 범인이 아님이 밝혀지고, 과학수사대는 다시 살인현장을 둘러보는데...
한편 호라시오는 검시실에서 도니의 사체 옆에 있던 사체가 물감 총을 진짜 총인 줄 알고 심장마비로 죽었다는 걸 알고, 레이가 이 죽음에 연루됐음을 직감한다. 설상가상 그날 밤 레이가 어울렸던 친구들은 모두 레이가 물감 총을 쐈다고 진술한다. 그러나 호라시오가 결정적인 증거를 찾아내 살인자가 될 뻔한 조카를 위기에서 구한다.
도니의 집을 다시 찾은 칼리와 에릭은 범인이 미닫이문에 남긴 얼굴 자국을 찾아내 결국 범인을 잡게 된다. 그러나 이 과정에서 미란다의 살해 당시 사진을 유심히 살펴보던 칼리는 도니가 부인을 죽인 것이 아니라 진범이 따로 있다는 사실을 알게 되는데...
EPISODE 7. 해일
대서양 바다 밑에서 발생한 화산의 붕괴로 인해 거대한 해일이 플로리다 해안을 덮칠 것이라는 예보와 함께 대피령이 내리자 불안한 시민들이 우왕좌왕하며 대피 물품을 준비하러 몰려든 한 대형 체인점 주차장에서 두 사람이 살해된 채 발견된다. 한 사람은 출소한지 얼마 되지 않은 전과자, 또 한 사람은 우연히 살인 현장을 목격하고 그 때문에 살해된 것으로 보이는 여대생. 호라시오 반장과 프랭크는 범인이 구매했다가 버리고 간 비상 사다리와 노끈, 소형 전지, 피해자가 소지하고 있던 권총 등을 토대로 살인자와 피해자가 함께 강도를 모의했던 것으로 보고 추적에 나서 유력한 용의자를 체포한다. 하지만 용의자는 혐의 내용을 완강히 부인하고 결국 증거 불충분으로 풀어 줄 수밖에 없게 되는데...
EPISODE 8. 스피드 살인
사우스 비치 어느 카페에서 열린 스피드 맞선 현장, 이 자리에 참석한 리차드가 그날 밤 시체로 발견된다. 과학 수사대는 리차드의 차가 아세톤으로 훼손된 것을 보고, 맞선 참가자 중 미용사인 매리를 의심하지만, 매리는 자신을 속이고 떠난 리차드가 미워서 차만 훼손시켰을 뿐, 맞선 행사가 끝나자마자 리차드가 급히 나가는 걸 봤다고 진술한다. 이에 마지막 파트너였던 레베카가 용의선상에 오르지만, 레베카는 자신의 집을 턴 도둑이 리차드인 줄 알고 뒤따라 나갔을 뿐이며, 리차드와 마지막으로 나눈 대화는 농구 얘기였다고 진술한다.
수사대는 레베카의 집을 턴 강도가 전과자인 채드이며, 그도 그 날 '스피드 맞선'에 참석한 걸 알고 채드를 추궁하지만, 그는 자신은 도둑질만 했을 뿐이고 그 날 리차드가 마지막에 뭔가를 보고 얼굴이 하얗게 질렸다고 말한다. 과학 수사대는 그게 '잭 스미스'임을 알아내지만 그의 이름과 주소는 모두 가짜로 판명된다. 수사대는 다시 리차드가 마지막으로 한 얘기인 농구 경기를 단서로 쫓다가 농구 경기장 사이트에서 리차드가 그 날 경기 후에 있었던 폭행 사건의 유일한 목격자이며, 그 폭행 사건으로 마커스란 소년이 중태에 빠졌음을 알게 된다.
수사대는 마커스 사건의 증거물에서 폭행범이 스카이박스 관람객이었음을 알아내고, 그 중 한 명이 미팅에서 '잭 스미스'란 가명을 썼던 '잭 웹스터'임을 알게 된다. 수사대는 잭의 반지에 묻어있는 마커스의 1회용 문신 자국으로 잭을 폭행범으로 체포하지만, 리차드의 사망 당시 카페 안에 있었다는 것이 증명되어 잭은 살해 혐의를 벗는다.
현장을 다시 조사하던 칼리와 에릭은 길바닥에 묻어 있는 흙이 건축 재료임을 알고 건설업자인 매리의 남편을 체포하지만, 그는 자신이 누명을 쓴 거라고 주장한다. 결국 매리가 리차드에게 모욕을 당한 후 홧김에 타이어 레버로 리차드를 때려죽인 후, 타이어 레버를 남편의 차에 갖다 놓은 것으로 밝혀진다.
EPISODE 9. 해적
신혼여행으로 찾은 플로리다 앞바다에서 다이빙을 즐기던 신혼부부가 밧줄로 연결된 채 닻에 묶여 가라앉은 남자 시신 6구를 발견한다. 산 채로 바다에 던져져 죽은 이들의 신원은 6일 전에 출항한 어선 아일린의 선원들. 호라시오 반장은 이들이 화물을 노리는 해적들에 의해 배를 탈취당한 후 살해된 것으로 보지만, 배에서 연락이 끊긴 지 6일이 되도록 실종 신고조차 하지 않고 있던 이 배의 선주는 살인범을 찾아내고 선박을 되찾는 일에 소극적인 자세를 보인다. 선주의 진술을 통해 아일린의 선원이 9명이었다는 사실을 알아낸 CSI는 조류의 흐름을 타고 표류하고 있을 구명정의 위치를 계산해 나머지 3명의 선원이 타고 탈출한 구명정을 찾아내지만 구명정에 타고 있던 3명 중 1명은 상어의 공격을 받고 이미 사망한 상태. 마침내 탈취 당한 아일린이 정박 중인 해적의 아지트를 찾아내는데 성공한 CSI는 기동대와 함께 현장을 덮치려다 뒤에서 날아오는 로켓포의 공격을 받는데...
EPISODE 10. 추락
한 남자가 아파트 3층 발코니 난간에 매달려 있다 떨어지는 장면이 길 건너 집의 여성에게 목격되고 현장에 달려간 CSI팀은 현장에서 즉사한 시신을 발견하지만 이 사망자는 추락하던 사람 밑을 지나다 눌려 죽은 것으로 밝혀진다. 정작 추락한 사람은 무슨 이유에선지 현장에서 달아나 버린 것이다. 남자가 추락한 것으로 보이는 아파트를 찾아간 CSI팀에게 집주인은 집안에서 내려오는 할머니의 반지가 없어졌다고 신고하지만 거짓인 것이 밝혀지자 결국 아무 것도 잃어버린 것이 없다고 주장한다. 그러나 건물 옥상에서 발견된 자일에서 채취된 DNA 검사를 통해 아파트에 침입했던 전문 절도범을 체포해 그가 아파트에서 훔친 것으로 추정되는 DVD를 찾아내고, 이 DVD 안에는 형사 사건 전문 판사 그린힐이 묘령의 여인과 정사를 벌이는 장면이 담겨 있는데...
EPISODE 11. 중독
결혼기념일을 맞아 식당을 찾은 콜맨 부부는 차량 탈취범에게 납치된 후 아내 케이는 추락 후 총에 맞아 사망하고 남편 모건만 살아난다. 제방에 떨어진 케이의 사체 부근 바위에 피가 흥건하자 칼리는 범인이 차 밖에서 죽였다는 것을 눈치챈다. 한편 모건이 치료를 받고 회사로 가는 것을 수상히 여긴 호라시오는 회사가 아버지가 물려준 것이며 살과 프레디란 두 형과 함께 일하고 있다는 것을 알게 된다. 회사가 큰 소송에 휘말린 것을 알고 호라시오는 가족 내부의 소행이 아닐까 짐작한다.
차량 탈취범인 빅터 티노코가 누군가에 의해 살해되고 케이를 죽였던 총과 일치하는 걸로 밝혀진다. 케이의 소지품에서 라이터와 임신 촉진제가 발견되고 그녀가 도박 빚을 갚으려 난자까지 팔고 있다는 사실이 드러난다.
EPISODE 12. 응급실의 총격전
마이애미 데이드 메모리얼 병원의 응급실... 괴한이 들어와 환자에게 총을 발사하고 이 환자가 응사하면서 순식간에 총격전이 벌어진다. 괴한은 '이스트 사이드'파의 조직원인 헥터로 밝혀지고, 총을 맞은 사람은 '텐트레이'파의 캘빈으로 밝혀진다.
라이언은 응급실에서 범인의 피가 묻은 파멜라의 옷을 수거하는데, 그 아이의 눈가에 멍이 있는 걸 보고 사고 후유증인가 싶어 조사하다가 아이의 입에서 섬유보풀을 발견하고 파멜라의 아동학대를 의심한다.
호라시오는 헥터의 휴대폰에 마지막으로 찍힌 번호로 전화를 걸고, 응급실 간호사인 라몬이 이 전화를 받는다. 라몬은 자신은 헥터에게 캘빈이 응급실에 있다는 걸 알려 주었을 뿐이며, 캘빈이 자기들 두목인 프리메로를 죽였기 때문에 복수를 한 거라고 말한다.
칼리와 에릭은 탄도 조사에서 캘빈의 목숨을 앗아간 탄환은 헥터가 아니라 제2의 총잡이가 쏜 것임을 알고, 응급실 주차장에 떨어진 차의 휠캡을 단서로 그 휠캡을 만든 에디를 찾아가 그 차의 주인이 제시임을 알아낸다. 에릭은 그 차의 바닥에 버려져 있던 해바라기씨와 차의 비밀금고에서 나온 총으로 리코를 캘빈의 살해범으로 체포한다.
호라시오는 이 총격전이 두목의 살해 사건에서 비롯된 갱들간의 복수전이란 사실에서 프리메로의 살해 사건을 조사하다가, 프리메로가 죽던 날 밤 캘빈은 교도소에 있었지만 '이스트 사이드'파가 캘빈을 프리메로의 살해범으로 오해하고 있었음을 알게 된다.
호라시오는 프리메로를 죽인 진범을 찾기 위해 프리메로의 아내인 애나를 찾아갔다가 뜻밖에 제시가 애나와 함께 살고 있는 걸 보고 애나의 부정과 관련이 있음을 직감한다. 한편 프리메로 살인사건의 유일한 목격자인 그 딸, 카르멘은 그냥 불을 봤다고 말한다. 수사대는 사건 당일, 애나가 폭행당한 흉기의 모양이 침대기둥에 찍힌 걸 보고 그 형상을 복구하는데...
한편 라이언은 보모인 파멜라가 부모의 사랑을 받지 못 하는 아기가 걱정되어 무단으로 애를 데려온 것을 알고 아이를 부모에게 돌려주지만 그 엄마가 아기에게 무관심한 걸 보고 파멜라를 석방해 준다.
EPISODE 13. 캅릴러
경찰이 꿈인 패트릭은 리치 인스코와 합동순찰을 하던 중 인스코가 총에 맞는 것을 목격한다. 현장에 출동한 감식반은 경찰이 죽고 동승한 패트릭 브루크너가 사라진 것을 알고 용의 차량을 수배한다. 그러던 중 용의 차량이 발견되고 차를 운전하던 미시는 용의자와 아무 관계가 없다고 말하지만 결국 거짓임이 드러난다. 칼리와 라이언은 미시와 살해용의자 조조가 편의점 강도 용의자란 것을 밝히고 고속도로 주변 편의점을 찾아 패트릭을 구조하게 된다. 단서를 종합해 조조의 위치를 파악하고 체포하지만 조조는 자신이 범인이란 걸 입증하라고 큰소리를 치고 총의 발사거리를 확인한 칼리는 조수석에서 쐈다고 확신하는데...
EPISODE 14. 사라진 가방
유람선이 몰려드는 시즌에 한 호텔에서 벨맨이 죽고 뒤 이어 투숙객인 에리카도 사체로 발견된다. 벨맨의 수하물표와 남겨진 가방에서 발견된 종이 뭉치로 위조지폐에 대한 가능성을 의심하게 된다. 에리카는 직원용 승강기에서 쓰러진 채 발견되고 부검으로 사인은 아스피린 알레르기 때문이며 합의 하에 성관계를 가졌다는 걸 알게된다. 에리카와 남편이 같이 참석했던 파티를 조사하던 중 할리와 미치가 용의선상에 오른다.
한편 가방 4개가 호텔을 빠져나간 경위를 조사하던 라이언은 불법택시 기사인 데이몬 바커를 만나 가방을 옮긴 창고 주소를 알아낸다.
EPISODE 15. 진짜와 가짜
호텔의 수영장 탈의실에서 살인 사건이 일어나고 신원 도용 사건이 일어난다. 살인 사건은 범인이 뱀이며 그 뱀의 주인이 마약을 밀수입한다는 사실을 알아내지만 밀수업자가 바라카스 외교관의 아들이라 외교관 면책 특권 때문에 증거가 있는데도 체포하지 못하고 신원 도용 사건은 추적 끝에 범인을 잡는 데 성공하지만 증거불충분으로 범인이 풀려나는데...
EPISODE 16. 탈주자
에버글레이즈에서 총상을 입은 채 악어에게 머리가 물린 시신이 발견되고 현장에 나간 에릭과 알렉스가 시신을 수거하려는 순간 폭발과 함께 현장은 화염에 휩싸인다. 화재 진압을 위해 죄수들이 동원되고 한 죄수가 시신으로 발견된다. 죄수 인원을 점검하던 호라시오는 진화 작업에 동원된 죄수 중에 한 명이 여전히 교도소에 있다는 사실을 알게 된다. 법정 모독죄로 수감된 사이러스가 자신의 9살짜리 아들을 강간한 유명 배우를 죽이기 위해 자신을 대신해 수감 중인 잔인한 킬러 토드를 화재 진압에 내보낸 것. 자유의 몸이 된 토드는 연달아 살인을 저지르는데... 한편, 악어 밥이 될 뻔한 시신은 밀주를 사려던 대학생의 시신으로 밝혀지고 화재 역시 밀주 증류소에서 비롯된 것으로 밝혀진다.
EPISODE 17. 그들의 자선파티
화물 비행기가 추락하고 기장과 부기장이 크게 부상당한다. 현장에서 현금 뭉치가 발견되고 젊은 여성이 사체로 발견된다. 칼리는 피터 엘리엇과 현금의 경로를 추적하고 그 돈이 사체로 발견된 케이틀린 타운젠드의 자선단체에서 흘러나온 것을 밝힌다. 사망시각을 추정한 결과 비행기에 탑승하기 전 이미 죽었고 가부검으로 익사한 사실도 알게 된 호라시오는 타운젠드 부인의 보좌관인 하이디와 자선단체의 공동 회장인 닉 마셜을 상대로 살해범을 가려내기 위해 다방향으로 수사를 진행한다.
EPISODE 18.
배를 운반하던 트럭에 충돌 사고가 나고 차 안에서 남자가 죽은 채로 발견되는데 사망 시각을 추정한 결과 교통사고가 나기 전 한밤중에 사망한 것으로 드러난다. 그리고 그 남자는 데이브 스트롱이 운영하는 게임 회사의 직원 제이크 설리반으로 밝혀지고 데이브와 제이크가 모종의 관계가 있었다는 것을 알게 된다. 용의자로 데이브와 함께 게임 테스터인 토드, 그리고 프로그래머인 론 벤슨이 떠오르지만 누구에게 혐의가 있는지는 알 수 없고 사건은 더 복잡하게 얽혀든다. 한편 전직 성인 영화 배우였던 사라는 남자 친구와 집에서 찍은 비디오 테이프가 사라져 호라시오 반장에게 도움을 구한다. 테이프의 행방을 쫓던 호라시오는 여러 경로를 거쳐 테이프가 사라의 남자 친구인 매튜를 통해 팔린 것을 밝혀낸다.
EPISODE 19. 국세청 직원의 죽음
하루에 두 명씩 국세청 직원이 총에 맞아 숨지는 사건이 벌어지자 호라시오는 납세자 명단에서 요주의 인물을 찾아 조사한다. 첫 피해자인 케빈 렌프로는 현장에서 총격전을 벌인 제이슨 위틀리의 짓으로 밝혀지지만, 두 번째 피해자인 사이먼 브레머는 용의자만 난무한 가운데 수사는 점점 꼬여든다. 먼저 사이먼을 살해한 9mm 총을 찾아 러셀 에지를 조사하지만 아무것도 모른다며 오리발을 내민다. 피살자, 사이먼이 독극물에 중독된 것을 알아낸 칼리는 그런 약품을 취급하는 용의자가 칼 도슨임을 알게 되고 그의 두 아들에 대해 호라시오는 묘한 관심을 가지게 되는데...
EPISODE 20. 인스턴트 사랑
외모가 잘생긴 남자들을 심사해 여자를 소개시켜 주는 사업을 하는 킴 버튼이라는 여자가 클럽 침대에서 살해되고, 베개에서 나온 증거로 범인이 여자라는 사실이 밝혀진다. 그리고 에릭은 무선 인터넷을 통해 만남을 가지는 '투싱'을 통해 낯선 여자와 데이트를 즐기다 CSI 배지를 분실하고 배지 분실 사건을 조사하던 릭 스테틀러에게 자신의 행동들이 죽은 스피들을 잊지 못해 자포자기한 행동이라는 말을 듣고 황당해 한다. 한편, 호라시오는 동생 레이몬드를 죽인 밥을 총기 사건 현장에서 보게 되고, 경찰을 죽인 밥이 출소한 것에 대해 의아해 하며 그를 쫓다 레이몬드가 죽지 않은 것을 알게 되는데...
EPISODE 21. 아버지라는 이름으로..
에이미를 사이에 두고 엄마 쉐리 라일과 아빠 브래드 매닝이 양육권 싸움을 벌인다. 아이를 몰래 데려갔다는 이유로 브래드는 접근 금지 명령까지 받은 상태지만 딸의 양육권은 절대 포기하지 못한다며 호라시오에게 도움을 청한다. 4시에 있을 법원의 사전 심리를 준비하다 브래드 매닝이 친부가 아닌 것과 쉐리가 자기 일에 딸을 이용하는 점을 알게 된다. 쉐리가 딸을 자신의 섹스 사업에 이용한다는 걸 아는 브래드는 법원 앞에서 쉐리를 살해하려고 하고 이를 막으려던 호라시오의 총에 죽게 되는데 총알 검사 결과 3발이 발사됐고 제3의 총잡이가 있다는 것을 알게 된다.
EPISODE 22. 15년 전의 복수
동창회 모임에서 패트릭 헤일이 둔기에 맞아 살해당하고 범행 무기는 샴페인 병으로 드러난다. 용의자로 패트릭과 밀회를 즐기던 미셸과 보험금을 노린 부인 등이 떠오르지만 확실한 증거를 찾지 못해 어려움을 겪는다. 그러던 중 동창회 파티에 나타난 댄이라는 보험 회사 영업 사원이 같은 고등학교를 중퇴한 사실을 알아내고 그를 추궁한다. 한편, 호라시오는 동생의 살해범인 밥 키튼이 자신의 집에서 총에 맞아 사망하고 사건 현장을 누군가 손댄 흔적을 발견하자 조심스럽게 증거를 찾아 나간다. 마약 거래상인 훌리오를 찾아가 사건 경위를 밝히려 하지만 그도 누군가에게 저격을 당한다.
EPISODE 23. 도끼 살인범
5년 전 해변가의 한 주택에서 커플을 도끼로 살해한 켄 크레이머의 사형 집행이 중지되자 호라시오는 새로운 증거 수집에 몰두한다. 실험실 전체가 그 사건에 매달리게 되고, 당시 피해자와 범인이 입었던 옷을 조사하던 칼리와 에릭은 옷에 나타난 코발트 성분으로 인해 공범이 있었다는 사실을 밝혀낸다. 그리고 피해자의 목을 조른 밧줄에서 켄의 친척이 공범이란 증거가 나오는데...
EPISODE 24. 또다른 이별
불법으로 열리는 파티 장소에서 폭발물이 터지고 현장에서 폭파범이 칼에 찔린 채 발견된다. 처음에는 사고로 폭발이 일어났다고 생각하지만 곧 그 장소가 테러를 준비하던 폭파범의 실험 장소란 것이 밝혀지고 폭탄에 사용된 원료를 추적한 결과 군부대에서 유출된 것으로 밝혀진다. 그리고 폭파범을 찌른 칼에서 레이몬드의 지문이 나온다. 레이몬드가 테러범과 연관이 있다는 사실을 안 호라시오는 옐리나와 조카 레이를 보호하기 위해 최선을 다하는데...
